Biolinux

Biolinux è una distribuzione Linux basata su Ubuntu e il desktop Unity che rende il pc una workstation potente e flessibile adatta per l’uso nella bioinformatica. Per questo si presenta con più di 500 programmi bioinformatici richiamabili da un apposito menu semplificato, offre l’accesso a una ricca documentazione sull’argomento e contiene diversi dati campione per poter testare i programmi.

Versione 7

Questa versione si presenta con:

• Sistema basato su Ubuntu 12..04 LTS, la release con supporto lungo di Ubuntu
• L’ambiente popolare Galaxy è installato e già configurato per l’utilizzo
• Contiene il software PredictProtein della Rost Lab
• Comprende le versioni più recenti del software per l’attività microbica (QIIME, Mothur, AmpliconNoise, RDP-classifier, ChimeraSlayer)
• Include i software Velvet, Tophat, Cufflinks e Bowtie
• Continua il supporto a tool classici di analisi bioinformatica: EMBOSS, BLAST, BLAST+, Artemis, ARB, e MrBAYES.
• Offre un design modulare che permette meglio di integrarsi in ubuntu e sui sitemi cloud
• Si può aggiornare direttamente dalla versione 6 senza problemi di sorta

Risorse

La distribuzione può essere scaricata da (2,6GB): http://nebc.nerc.ac.uk/downloads/bio-linux-7.0.3.iso

Il sito web della distribuzione è: http://envgen.nox.ac.uk/tools/bio-linux

Screenshot

Biolinux 7: l’ambiente con Unity

Conclusioni

Esistono molte distribuzioni Linux specializzate per offrire il meglio possibile per un determinato settore (es: networking, recovery, …), e BioLinux non è da meno nel suo campo.

Se siete ricercatori universitati o comunque lavorate nel settore della bioinformatica BioLinux è il coltellino svizzero del caso 😉